Primer Premier v6.0 绿色版

Primer Premier是一款在基因工程专业上会经常使用到的引物设计软件，我们可以通过Primer Premier来完成引物设计、序列编辑、酶切分析等多种操作，并且这款Primer Premier软件还可以帮助用户快速分析各项数据，获取最为准确的结论数据。

Primer Premier软件特色

Primer Premier软件还可以针对模板DNA 的来源以相应的遗传密码规则转换DNA 和氨基酸序列。软件共给出八种生物亚结构的不同遗传密码规则供用户选择，有纤毛虫大核(Ciliate Macronuclear)、无脊椎动物线粒体(Invertebrate Mitochondrion)、支原体(Mycoplasma)、植物线粒体(Plant Mitochondrion)、原生动物线粒体(Protozoan Mitochondrion)、一般标准(Standard)、脊椎动物线粒体(Vertebrate Mito-chondrion)和酵母线粒体(Yeast Mitochondrion)。Primer Premier软件有优秀的引物自动搜索功能，同时可进行部分指标的分析，而且容易使用，已被引物设计行业人士认为是一款相当不错的软件。

Primer Premier功能介绍

1.主要界面可分为序列编辑窗口（Genetank），引物设计窗口（Primer Design），酶切分析窗口（Restriction Sites）和纹基分析窗口（Motif）四大块

2.该软件就是用来进行引物设计的

3.可以简单地通过手动拖动鼠标以扩增出相应片段所需的引物

4.在手动的任何时候，下面显示各种参数的改变和可能的二聚体、异 二聚体、发夹结构等。也可以给定条件，让软件自动搜索引物，并将引物分析结果显示出来

5.进行这些操作非常简单

Primer Premier安装方法

1、下载解压后双击PP600Installer.exe启动安装包，然后勾选同意协议点击Next

2、直接点击Next就好

3、选择好安装位置然后点击Install

4、等待安装完成

5、安装完成后点击Done结束安装

Primer Premier使用技巧

一、限制性酶切点分析及基元查找功能

1.其主要功能在主界面上一目了然。限制性酶切点分析及基元查找功能比较简单，点击该功能按钮后，选择相应的限制性内切酶或基元（如-10 序列，-35 序列等），按确定即可

2.常见的限制性内切酶和基元一般都可以找到,你还可以编辑或者添加新限制性内切酶或基元

二、引物设计

1.打开DNA序列后点击按钮primer，出现“search criteria”窗口，有多种参数可以调整

2.搜索目的（Seach For）有三种选项，PCR 引物（PCR Primers）、测序引物（Sequencing Primers）和杂交探针（Hybridization Probes）

3.搜索类型(Search Type)可选择分别或同时查找上、下游引物（Sense/Anti-sense Primer，或Both），或者成对查找（Pairs），或者分别以适合上、下游引物为主（Compatible with Sense/Anti-sense Primer）。另外还可改变选择区域（Search Ranges），引物长度（Primer Length），选择方式（Search Mode），参数选择（Search Parameters）等等

3.使用者可根据自己的需要设定各项参数。如果没有特殊要求，建议使用默认设置。然后按search，随之出现的Search Progress 窗口中显示Search Completed 时，再按OK，这时搜索结果以表格的形式出现，有三种显示方式，上游引物（Sense），下游引物(Anti-sense)，成对显示(Pairs)。默认显示为成对方式，并按优劣次序（Rating）排列，满分为100，即各指标基本都能达标

三、引物点击

1.点击其中一对引物，如第1#引物，并把上述窗口挪开或退出，显示“Peimer Premier”主窗口，所得结果分三部分，

2.模板及产物位置，中间是所选的上下游引物的一些性质，最下面是四种重要指标的分析，包括发夹结构（Hairpin），二聚体（Dimer），错误引发情况（False Priming），及上下游引物之间二聚体形成情况（Cross Dimer）

3.当所分析的引物有这四种结构的形成可能时，按钮由变成，点击该按钮，在左下角的窗口中就会出现该结构的形成情况

4.一对理想的引物应当不存在任何一种上述结构，因此最好的情况是最下面的分析栏没有，只有。值得注意的是中间一栏的末尾给出该引物的最佳退火温度

四、引物修饰编辑

1.在需要对引物进行修饰编辑时，如在5’端加入酶切位点，可点击，然后修改引物序列

2.若要回到搜索结果中，则点击按钮。如果要设计简并引物，只需根据源氨基酸序列的物种来源选择前述的八种遗传密码规则，反推至DNA 序列即可3.对简并引物的分析不需像一般引物那样严格

4.总之，“Premier”有优秀的引物自动搜索功能，同时可进行部分指标的分析，而且容易使用，是一个相当不错的软件