DnaMan绿色版是由美国Lynnon Biosoft公司开发的一款高度集成化的分子生物学综合应用软件。DnaMan绿色版可用于多序列比对、PCR 引物设计、限制性酶切分析、质粒绘图、蛋白质分析等,几乎涵盖所有日常核酸、蛋白质序列的分析工作。DnaMan绿色版还可以不同形式来显示序列,包括显示序列和成分、显示待分析序列的反向序列、显示待分析序列的反向互补序列和显示待分析序列的对应RNA序列等。同时DnaMan绿色版可进行序列同源性分析,包括两序列同源性分析和多序列同源性分析。DnaMan绿色版速度、多功能性、准确性和高质量的呈现,使该软件成为每个分子生物学家都可以依赖的基本工具之一。
不仅如此,DnaMan绿色版提供了20个序列通道以将活动序列保留在内存中,简化了多种功能分析,并大大提高了工作效率。除此之外,DnaMan绿色版内置的图形分析,能够将自己的实验数据发布到软件上,利用自动统计以及图表功能获得详细的数据走势分析,为后期的模拟实验提供重要的参考数据,可以说是一款非常优秀的生物学综合应用软件,对于从事生物研究工作的朋友会有极大帮助,所有生命科学工作者、研究人员需要的一款工具,有需要的朋友可以下载体验哦。
1、DNA和蛋白质序列编辑。
2、DNA序列转化。
3、多序列比对,对齐编辑和分析。
4、系统树分析。
5、DNA或蛋白质序列的点阵比较。
6、DNA序列组装和编辑。
7、BLAST通过网络界面在Intranet / Internet Server上进行搜索。
8、序列和数据库中的增强型图案搜索。
9、SiRNA选择器。
10、限制分析。
11、绘制序列图与出版品质。
12、限制模式预测。
13、电子克隆。
14、从限制片段重建限制图。
15、静音突变分析创建/破坏限制性位点。
16、导向不匹配以创建/破坏限制站点。
17、翻译和密码子使用分析。
18、蛋白质疏水性/亲水性分析。
19、蛋白质表征:等电点的序列组成和预测。
20、蛋白质二级结构预测。
21、反向翻译。
22、PCR和测序引物的设计。
23、表征DNA或引物序列的热力学性质。
24、分歧分析。
25、管理寡核苷酸,DNA和蛋白质数据库。
26、生成随机序列。
【如何用DNAMAN软件得到反向互补的DNA序列】
1、打开在本站下载好的DNAMAN软件,打开软件后,点击软件顶部的点击File,在弹出的选择中选择new
2、在新建好的对话框中输入DNA序列。
3、输入完后,同时按住键盘上Ctrl和A,选中序列,并单击软件顶部“seq”图中以为大家标注出来。
4、然后点击软件顶部的Sequence选项,在弹出的选项中点击Display,在二级菜单中点击Rev.Compl.Sequence
5、然后就可以得到原序列的反向互补序列。
【DNAMAN设计引物】
1、先要拿到自己要设计引物的目的基因。
2、打开DNAMAN软件,打开软件后点击软件菜单栏的Primer选项,在弹出的选择中选择Load Primer,在二甲菜单中选择From Input选项。
3、导入文件后,点击菜单栏的Primer选项,在弹出的选项中选择Melting Temperature。
4、打开Melting Temperature对话框,您可以修改Thermo这个选项,Thermo值一般在55℃到70℃之间比较好。
5、从上图可以看到我们这20个碱基的Tm值只有49度,显然太低,需要增加碱基数量。我们取前24个碱基粘贴进去,点击下方Show Tm便可以看到这个引物的Tm值,发现是60.3度,很合适,就用这个了。这样正向引物就设计完了,把这24个碱基序列保存下来。
如何用DNAMAN导出序列比对图?
1、打开DNAMAN软件,打开软件后,点击菜单栏的Sequence选项,在弹出的选项中选择Load Sequence,在弹出的二级菜单中点击Multiple,选择您要添加对比的文件。
2、导入序列后,点击Sequence,在弹出的选项中选择Alignment,再选择Multiple Sequence Alignment,参数全部保持默认,点“下一步”就可以。
3、然后就可以得到最终对比结果。
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